Národní číselník laboratorních položek verze 1.0 (základní) listopad 1996 Odborné společnosti spolupracující na systému Společnosti ČLS JEP: B - Společnost klinické biochemie H - Česká hematologická společnost T - Společnost pro transfúzní lékařství I - Česká společnost pro alergologii a klinickou imunologii N - Společnost nukleární medicíny M,V - Společnost pro epidemiologii a mikrobiologii (v jednání) Z - Česká společnost zdravotnické informatiky a vědeckých informací Adresy předsedů odborných společností (1996): --------------------------------------------- Společnost klinické biochemie doc. MUDr. V. Palička, CSc. Ústav klinické biochemie a diagnostiky Fakultní nemocnice 50036 Hradec Králové Česká hematologická společnost doc. MUDr. K. Indrák, DrSc. Hematologická klinika Fakultní nemocnice I. P. Pavlova 6 77520 Olomouc Společnost pro transfúzní lékařství MUDr. V. Veselý, CSc. Transfúzní oddělení U nemocnice 2 12808 Praha 2 Česká společnost pro alergologii a klinickou imunologii prof. MUDr. V. Špičák, CSc. Dětské oddělení Nemocnice Na Bulovce Budínova 2 18081 Praha 8 Společnost nukleární medicíny MUDr. J. Masopust, CSc. Odd. nukleární medicíny Nemocnice Na Homolce Roentgenova 2 15119 Praha 5 Česká společnost zdravotnické informatiky a vědeckých informací doc. MUDr. Š. Svačina, CSc. III. interní klinika 1. LF UK U nemocnice 1 12808 Praha 2U Autorský kolektiv Editoři národního číselníku laboratorních položek: -------------------------------------------------- Ing. Miroslav Zámečník Katedra klinické biochemie IPVZ, Praha Oddělení klinické biochemie NsP Kladno Vančurova 1548 CZ-27259 Kladno tel. +42-312-606325 MUDr. Antonín Jabor, CSc. Oddělení klinické biochemie NsP Kladno Vančurova 1548 CZ-27259 Kladno tel. +42-312-606325 Autorský kolektiv: ------------------ Je uváděn: kód autora, gesce, zahájení - ukončení spolupráce titul, jméno, příjmení adresa pracoviště v době spolupráce BA, N, 1995 - Ing. Vladimír Bartoš KNM, FN, 17. listopadu 1790, 70852 Ostrava Poruba RB, B, 1996 - Ing. Radovan Bílek Endokrinologický ústav, Národní 8, 116 94 Praha 1 VB, B, 1994 - 1995 MUDr. Vladimír Blažej, CSc. OKB, Nemocnice NH, Pavlova 31, 70400 Ostrava 3 PB, B, 1995 - 1995 RNDr. Petr Bořil OKB, Nemocnice, Vančurova 1548, 27259 Kladno BR, B, 1996 - RNDr. Petr Breinek OKB, FN, U sv. Anny, Pekařská 53, 65691 Brno DB, B, 1996 - MUDr. Daniel Břešťan OKB, Nemocnice, Vančurova 1548, 27259 Kladno TB, B, 1994 - RNDr Tamara Bulková CALCULI, Kociánka 13, PS 30, 61200 Brno RO, B, 1996 - Ing. Robert Bullawa OKB, Nemocnice, Vančurova 1548, 27259 Kladno LD, B, 1996 - RNDr. Luděk Dohnal OKB, VFN, 1. LF UK, Karlovo náměstí 32, 12111 Praha 2 BF, B, 1994 - RNDr. Bedřich Friedecký Ústav klin. biochemie a diagnostiky, FN, 50036 Hradec Králové AJ, B, 1993 - MUDr. Antonín Jabor, CSc., OKB, Nemocnice, Vančurova 1548, 27259 Kladno KJ, B, 1994 - MUDr. Karel Ježek OKB, ZÚNZ - UP, 26105 Příbram Zdaboř JI, B, 1994 - MUDr. Milan Jirsa I. int. klinika, 1. LF UK, U nemocnice 2, 12800 Praha 2 KA, B, 1996 - RNDr. Jaromír Kamarýt, CSc. Výzkumný ústav zdraví dítěte, Černopolní 9, 66262 Brno AK, B, 1994 - Prof.MUDr. Antonín Kazda, DrSc. OKB, VFN, 1. LF UK, Karlovo náměstí 32, 12111 Praha 2 KO, B, 1994 - MUDr. Petr Kocna, CSc. Gastroenterologie, 1.LF UK, Karlovo náměstí 32, 12111 Praha 2 MK, M, 1996 - 1996 MVDr. Milan Kolář Ústav lék. mikrobiologie, LF VP, Hněvotínská 3, 77515 Olomouc JK, B, 1995 - RNDr. Josef Kratochvíla OKB, Nemocnice, 28802 Nymburk PK, B, 1996 - ing. Josef Kubiš OKB, Hornická NsP s.r.o., Pražská 206, 41801 Bílina IL, I, 1995 - RNDr. Ivo Lochman, CSc. KHS, Odbor imunologie, Partyzánské nám. 7, 72892 Ostrava OM, B, 1996 - Ing. Oldřich Mach OKB, NsP, Purkyňova 1849, 47077 Česká Lípa MM, B, 1996 - RNDr. Milan Malý OKB, Nemocnice, Svitavská 25, 57116 Moravská Třebová HN, B, 1994 - 1995 RNDr. Hana Nekvasilová BIO-VENDOR, Severozápadní IV 23, 14100 Praha 4 VP, B, 1995 - doc. MUDr. Vladimír Palička, CSc. Ústav klin. biochemie a diagnostiky, FN, 50036 Hradec Králové MP, H, 1995 - RNDr. Miroslav Pecka, CSc. OKH, 2.int. klin., FN, Pospíšilova 365, 50036 Hradec Králové MI, T, 1996 - MUDr. Martin Písačka ÚHKT, U nemocnice 1, 12820 Praha 2 JR, B, 1994 - 1995 doc. MUDr. Jaroslav Racek, CSc. OKB, FN, Dr. E. Beneše 13, 30100 Plzeň HR, B, 1994 - 1995 MUDr. Jan Rokyta OKB, Nemocnice, 43464 Most PS, B, 1996 - doc. MUDr. Petr Schneiderka, CSc. OKB, VFN, 1. LF UK, Karlovo náměstí 32, 12111 Praha 2 SK, N, 1996 - RNDr. Kristián Šafarčík Generála svobody 6, 74801 Hlučín JV, B, 1994 - Ing. Jaroslava Vávrová Ústav klin. biochemie a diagnostiky, FN, 50036 Hradec Králové FV, B, 1996 - Ing. František Všianský OKB, Nemocnice NH, Pavlova 31, 70400 Ostrava 3 MZ, Z, 1993 - Ing. Miroslav Zámečník KKB IPVZ, OKB, Nemocnice, Vančurova 1548, 27259 Kladno PZ, I, 1995 - MUDr. Pavel Žampach OKI, Nemocnice, B. Němcové 54, 370 01 České Budějovice EZ, M, 1996 - MUDr. Eva Žampachová Virologie, Nemocnice, B. Němcové 54, 370 01 České Budějovice LG, (rezervovaný kód pro literární citace) Autoři programu "SLP": RNDr. Luděk Straka, Pejevové 3126, 14300 Praha 4 Ing. Miroslav Zámečník, KKB, IPVZ, Praha Technická spolupráce: Jana Sedláková, OKB, Nemocnice, 27259 Kladno Úvod "Národní číselník laboratorních položek" je vytvořen pro potřebu zdravotnické odborné veřejnosti. Je součástí "Datového standardu pro předávání dat o pacientech mezi informačními systémy zdravotnických zařízení verze 01.10". Národní číselník laboratorních položek je komponován v těsné vazbě na doporučení mezinárodní terminologické skupiny IUPAC/IFCC zejména s přihlédnutím ke standardu "The Silver Book" a dalším navazujícím dokumentům. Národní číselník důsledně respektuje normu SI, závazně platnou od 1. ledna 1980. Národní číselník je základem pro standardní komunikaci mezi laboratorními obory a medicínskými uživateli výsledků. Neformální pracovní skupina pro tvorbu národního číselníku vznikla z iniciativy Katedry klinické biochemie IPVZ a výboru Společnosti klinické biochemie. Vývoj národního číselníku byl sponzorován a realizován ve spolupráci s firmou STAPRO Pardubice. Na základě jednání mezi Společností klinické biochemie, Ministerstvem zdravotnictví a firmou STAPRO byl číselník v nulté verzi darován firmou STAPRO k veřejnému použití. Další vývoj do verze 1.0 byl podporován převážně prostředky Ministerstva zdravotnictví ČR. Přestože byl vznik pracovní skupiny iniciován převážně členy Společnosti klinické biochemie, od počátku byla pracovní skupina otevřena všem pracovníkům laboratorních oborů, kteří o spolupráci projevili zájem. Z pověření MZd ČR vyzvala Společnost klinické biochemie ke spolupráci i další odborné společnosti, které se postupně připojovaly k práci. V předkládané variantě národního číselníku verze 1.0 je obsažena většina základních laboratorních položek, které využívá také praktický lékař. Pro tohoto uživatele, často vzdáleného od místa vzniku laboratorních údajů, je moderní způsob komunikace pomocí standardně definovaných komunikačních protokolů jednoznačnou perspektivou. Tento aspekt proto byl také jednou součástí řešení verze 1.0. Jedním z cílů předkládané práce je zavést takové názvy veličin a odvozených veličin, používaných v klinických laboratořích, které jsou exaktně matematicky definované a odpovídají jejich logickému smyslu. Dosavadní názvy odvozených veličin byly velmi často nepřesné a nejednoznačné. Toto "triviální" historické názvosloví pocházelo buď z povrchních označení vlastností veličin, nebo z názvů procesů, s nimiž byly veličiny spojeny. Jako příklad lze uvést absorpci a její zcela odlišný význam ve spektroskopii a při studiu dějů na površích pevné fáze. Komise IUPAC/IFCC se při vytváření doporučeného názvosloví řídily zásadou potřeby názvů veličin jednotného, mezinárodního, interdisciplinárního charakteru, definovaných pokud možno na bázi matematických vztahů. Jazykem tohoto názvosloví je angličtina, kterou však bylo nezbytné v některých případech modifikovat pomocí francouzské gramatiky. Takto vytvořená soustava koherentně (bez logických rozporů) propojuje systémy, složky, veličiny a jednotky (viz dále). Potřeba takové soustavy je pochopitelná, ale jen zdánlivě jednoduchá. Evidence takové soustavy je však bazální podmínkou bezchybné komunikace mezi klinickými laboratořemi, jejich pracovníky a pracovníky různých oborů medicíny. Vlastním objektem vyšetřování v klinické laboratoři je systém představující druh biologického materiálu, charakteristického svým původem, složením a významem pro diagnostiku v klinických laboratořích: krev, moč, sérum, plasma, amniová tekutina, mozkomíšní mok, erytrocyty, leukocyty a řada dalších, ale systémem může být také např. hemoglobin, pokud stanovujeme jeho jednotlivé frakce (methemoglobin, karbonylhemoglobin atd.). Vyšetřování jednotlivých systémů probíhá nejčastěji tak, že se stanovují (kvantitativně) nebo detegují (kvalitativně) jeho jednotlivé složky - komponenty. Složky (komponenty, případně analyty) jsou definovaná látková individua - entity, z nichž je systém složen. Metody, pomocí nichž se komponenty vyšetřují nebo měří, jsou označovány jako procedury. Znaky, vlastnosti, které se u složek stanovují nebo detegují, jsou označovány jako veličiny. Kvantifikace jednotlivých veličin se provádí pomocí jednotek měření. Všude tam, kde je komponenta exaktně chemicky definována, mělo by být používáno mezinárodních jednotek měření SI units. Pro pojem veličina bylo v mezinárodním doporučeném názvosloví původně používáno výrazu "QUANTITY". Protože však všechny veličiny, měřené nebo detegované ve vyšetřovaných systémech nemají kvantitativní charakter (barva, zápach, citlivost a pod.), byl navržen název nový - "PROPERTY". My však budeme dál používat jako českého ekvivalentu názvu veličina (quantity), protože případný ekvivalent vlastnost (property) by byl v daných souvislostech málo srozumitelný. Ve vybraných číselnících se v programu pro pořizování národního číselníku používají anglické termíny nebo jejich zkratky. Důvodem je jednak porovnání s mezinárodním standardem, jednak spolupráce na tomto standardu a v neposlední řadě snaha o zajištění návaznosti na publikaci "The Silver Book". Možnost konzultovat zahraniční odborníky a prezentovat odbornou činnost laboratorních oborů jistě také není zanedbatelným důvodem. Součástí národního číselníku laboratorních položek jsou také datové strutury, které umožňují vzájemné a standardizované obousměrné propojení národního číselníku s interním číselníkem, který je dosud používaný v konkrétní (lokální) laboratoři nebo v konkrétním informačním systému. Každá položka definovaná v národním číselníku může být fakultativně propojena s příslušným popisem interpretačních škál a/nebo s příslušnými texty repetitoria. V konkrétní podobě je národní číselník vytvářen autorským kolektivem a kompletován editorem v podobě databazových souborů LABPOL (národní číselník) a KONVPOL (konverzní číselník) a případně i fakultativní soubor SKALY (interpretační škály). Z těchto databazových souborů jsou vytvářeny různé typy souborů, které jsou určeny pro distribuci a které mohou využívat mnohé informační systémy. Tyto soubory jsou také součástí "Standardního datového rozhraní pro předávání dat o pacientech mezi informačními systémy zdravotnických zařízení verze 01.01 a vyšší". Pro tyto účely jsou k dispozici následující základní distribuční soubory: - LABPOLZ (vytvářený z LABPOL - základní datový soubor) - LP_SYST (interní číselník systémů) - LP_KOMP (interní číselník komponent a jejich názvů) - LP_PROC (interní číselník procedur) - LP_DKVAN(interní číselník druhů veličin) - LP_TYPD (interní číselník typů dialogových položek) - LP_FRM (interní číselník formátů referenčních mezí) - LP_FH (interní číselník formátů hodnot) - LP_MTV (interní číselník matic textových výsledků) - LP_KONV (vytvářený z KONVPOL - fakultativní - pro potřebu informačních systémů k realizaci vazeb mezi národním a lokálním číselníkem - k dispozici ve formě struktury) Tyto vyjmenované soubory jsou bezplatně k dispozici pro potřebu všech oprávněných uživatelů. Budou-li používány v libovolném informačním systému nebo programu, mohou být s ním dále šířeny, ale vždy pouze s výrazným upozorněním, že jsou k dispozici bezplatně a s uvedením zdroje, kde byly získány a kde bude možné získat další inovované verze. Základní definice Základní definice vypracovala pracovní skupina pro terminologii, sémantiku a znalostní báze ve zdravotnictví CEN/TC 251 (European Committee for Standardisation, Technical Committee 251 - Medical Informatics, Working Group 2: Healthcare Terminology, Semantics and Knowledge Bases). Jedná se zejména o evropský prestandard ENV 1614 "Health care informatics: Structure for nomenclature, classification, and coding of properties in clinical laboratory sciences" a série dokumentů IUPAC/IFCC "Properties and units in the clinical laboratory sciences", zejména "I. Syntax and semantic rules" , "II. Kinds-of-property", "III. Terms and code values", "IV. Systems, components, kind-of-quantities, specifications, and units", "V. Properties and units in thrombosis and haemostasis", "VI. Properties and units in IOC defined drugs of abuse" a dalších. V terminologických skupinách IUPAC/IFCC má zastoupení i autorský kolektiv národního číselníku laboratorních položek a naše země se tak podílí i na některých oficiálních překladech vypracovávaných dokumentů. Terminologické otázky se někdy stávají nejen odborným problémem, ale i problémem z hlediska zvláštností českého jazyka. Dále jsou uvedeny navržené pojmy (jejich český překlad z anglického tvaru), původní anglický tvar (v kulatých závorkách), bližší popis a příklad (v hranatých závorkách): 1. charakteristika (characteristic) Mentální reprezentace vlastnosti objektu sloužící k formulování a ohraničení jeho konceptu. 2. komponenta (component) Definovatelná část systému. [krevní plazma určitého pacienta specifikovaná v času a prostoru, glukóza v určité časem definované porci moče určitého pacienta, proces koagulace v identifikovaném vzorku krve] 3. koncept (concept) Myšlenková jednotka vytvořená abstrakcí na základě vlastností společných skupině objektů. 4. nezbytný typ charakteristiky (essential type of characteristic) Typ charakteristiky, který je považován za nezbytný po vytvoření většiny konceptových systémů v dané oblasti. [generic system + generic component + kind-of-property] 5. vyšetření (examination) Sestava operací s cíle určit hodnotu vlastnosti/veličiny. 6. generická komponenta (generic component) Definovatelná část generického systému. [krevní plazma člověka, glukóza v lidské moči, koagulace v krvi] 7. generická vlastnost (generic property) Koncept, jehož objekty jsou vlastnosti se společným generickým systémem, generickou komponentou (komponentami) a druhem vlastnosti/veličiny. [barva pacientovy moče, v systematickém zápisu Patient--Urine; colour] 8. generická veličina (generic quantity) Koncept, jehož objekty jsou meřitelné veličiny se společným generickým systémem, generickou komponentou (komponentami) a druhem veličiny. [délka lidského těla, délka těla Jana Nováka, nespecifikováno v čase] 9. generický systém (generic system) Koncept, jehož objekty jsou systémy se společnými generickými elementy a vztahy mezi těmito elementy. [osoba; moč; trombocyty v lidské krvi; každý v obecném smyslu, bez vyznačení místa nebo času] 10. druh vlastnosti (kind-of-property) Funkce, která z jedné nebo více vlastností/veličin systému a žádné nebo více vlastností komponent tohoto systému vytváří vlastnost/veličinu systému. [hmotnostní koncentrace; klasifikace; barva; koncentrace substance; délka] 11. druh veličiny (kind-of-quantity) Funkce, která z jedné nebo více veličin systému a žádné nebo více vlastností komponent tohoto systému vytváří veličinu systému. [objemový podíl; hmotnostní koncentrace; obecně se jedná o subtypy druhů vlastností] 12. měřitelná veličina; veličina (measurable quantity; quantity) Atribut fenomenu, těla nebo substance, která může být odlišena kvalitativně a určena kvantitativně. [délka těla (výška) určité osoby v určitém čase] (jedná se o podtyp vlastnosti/veličiny) 13. měření (measurement) Soustava operací s cílem určit hodnotu veličiny. pozor - následující termíny nejsou synonyma pro "měření": metoda měření měřicí procedura test assay pozorování výsledek měření 14. měřicí postup (measurement procedure) Soustava operací, specificky popsaná, která se používá u určitého měření podle určité metody. pozor - rozdíl mezi měřením a měřicí procedurou: měření = množina operací měřicí procedura = množina instrukcí, jak provést tyto operace 15. multiaxiální klasifikace (multiaxial classification) Systém konceptů se strukturou závislou na počtu vybraných charakteristik. 16. pozorování (observation) Vyšetření, které není měření. 17. vlastnost (property) Atribut systému, který může být vyšetřován, aby se získala hodnota sloužící k popisu systému. [Patient(John Smith;1993-05-07,08:00/14:30)--Urine; colour=red] [Patient(Anne Stewart;1993-06-09)--Sodium ion; substance concentration = 139 mmol/l] 18. škála (scale) Množina možných hodnot proměnné. nominální škála (nominal scale) množina údajů, z nichž každý má jedinečné jméno nebo symbol, pořadí údajů je dohodnuté [krevní skupiny: A B AB 0] pořadová škála (ordinal scale) uspořádaná množina údajů, z nichž každý je symbolizován slovem nebo kombinací čísel a slov označujících velikost [0 1 2 3, nebo nedetekován, slabě pozitivní, pozitivní, silně pozitivní] rozdílová škála (difference scale) uspořádaná množina údajů, z nichž každý je součinem čísla a jednotky měření, takže stejný rozdíl na škále odpovídá stejnému rozdílu velikosti měřených veličin [Celsiova stupnice] racionální škála (ratio scale) uspořádaná množina údajů, z nichž každý je součinem čísla a jednotky měření, kde nulové hodnota odpovídá přirozené nulové hodnotě proměnné, takže stejné poměry mezi hodnotami na škále odpovídají stejným poměrům mezi velikostmi měřených veličin [koncentrace sodného ionu v plazmě] 19. množina (set) Konečná nebo nekonečná skupina objektů, entit nebo konceptů. 20. specifikace (specification) Typ charakteristiky vztažený k jedné z nezbytných typů charakteristik. 21. systém (system) Ohraničená část reálného nebo vnímatelného vesmíru, existující v čase a prostoru, která může být považována za množinu elementů a jejich vzájemných vztahů. 22. systematický název (systematic name) Jméno odrážející principy relevantní strukturované terminologie. 23. soustava konceptů (system of concepts) Strukturovaná množina konceptů vytvořená podle jejich vztahů, každý koncept je určen jeho pozicí v množině. 24. typ charakteristiky (type of characteristic) Jakákoli kategorie charakteristiky použitá jako kriterium pro utvoření generického systému konceptů. 25. jednotka měření; jednotka (unit of measurement; unit) Určitá veličina, definovaná a přijatá konvencí, pomocí které jsou jiné veličiny stejného druhu porovnávány za účelem vyjádření jejich velikosti vztažené k této veličině. (V národním číselníku označováno jako "jednotka konvenční".) 26. hodnota vlastnosti; hodnota (value of a property; value) Element škály vzhledem ke kterému se vlastnost/veličina pozoruje nebo měří. 27. hodnota veličiny (value of a quantity) Velikost určité veličiny obecně vyjádřená jako jednotka měření násobená číslem. Schéma vazeb mezi základními pojmy Každá VELIČINA je definována pomocí systému (a jeho specifikací, případně supersystémem), druhem veličiny (a její specifikací, často v návaznosti na vyšetřovací proceduru) a vlastní komponenty (a její specifikací). S druhem veličiny je svázána škála (přípustné množiny výsledků) a jednotka. nominální škála jednotka ordinální škála diferenční škála vyšetřovací postup škála racionální škála specifikace druh veličiny systém komponenta V > veličinainterní číselník. Řekneme-li, že PROC1 a PROC2 (definované v národním číselníku) jsou v tomto příkladu prakticky zaměnitelné, ale PROC3 je velmi speciální, budou vazby uvedeným směrem následující: NIS LIS národní číselník položek interní číselník položek SYST_KOMP_* ----------> SYSTi_KOMPi_PROCi1 SYST_KOMP_PROC1 ----------> SYSTi_KOMPi_PROCi1 SYST_KOMP_PROC2 ----------> SYSTi_KOMPi_PROCi1 SYST_KOMP_PROC3 (bez vazby) laboratoř neprovádí, požadavek odmítne nebo předá jiné laboratoři Takto by bylo postupováno například při elektronickém zasílání požadavků na vyšetření z NIS do LIS. Laboratoř by si převedla požadavky na odpovídající položky svého interního číselníku. K tomu by využila dialogovou položku "ŘEŠÍME JAKO", která umožňuje definování vazby mezi "n" položkami národního číelníku a jednou položkou číselníku interního. V tomto příkladu by to tedy znamenalo, že u položek SYST_KOMP_* a SYST_KOMP_PROC2 bude v interním číselníku uveden odkaz na interní položku SYSTi_KOMPi_PROCi1, kterou laboratoř zpracovává. Tento odkaz bude zapsán do položky ŘEŠÍME JAKO. Fakultativně může být takto vyplněna položka ŘEŠÍME JAKO také pro položku SYST_KOMP_PROC1 (toto záleží na používaném LIS). Z hlediska komunikace s LIS lze říci, že položka ŘEŠÍME JAKO slouží hlavně pro komunikaci směrem k LIS. 1b.) V opačném směru, když bude laboratoř výsledky vydávat, budou vazby následující: VÝSTUP Z LIS LIS národní číselník položek interní číselník položek SYST_KOMP_* (bez vazby) SYST_KOMP_PROC1 <---------- SYSTi_KOMPi_PROCi1 SYST_KOMP_PROC2 (bez vazby) SYST_KOMP_PROC3 (bez vazby) Pro komunikaci v datovém standardu může laboratoř "naplnit" pouze položku s odpovídající procedurou. K definici této vazby využije laboratoř dialogovou položku "INTERNÍ KÓD", která slouží k definování jednoznačné vazby mezi jednou položkou interního číselníku a odpovídající jednou položkou národního číselníku. Z hlediska komunikace s LIS lze říci, že položka INTERNÍ KÓD slouží hlavně pro komunikaci směrem z LIS. 1c.) Pokud by byl výsledek z laboratoře odeslán prostřednictvím datového standardu do jednoduchého inf. systému, který nedokáže rozlišovat procedury "PROC", mohly by být vazby na straně příjemce (v tomto případě uživatele laboratorního výsledku např. praktického lékaře) následující: VÝSTUP Z LIS JINÝ IS národní číselník položek interní číselník položek SYST_KOMP_*> SYSTi_KOMPi_* SYST_KOMP_PROC1 ----------> SYSTi_KOMPi_* SYST_KOMP_PROC2 ----------> SYSTi_KOMPi_* SYST_KOMP_PROC3 (bez vazby, řešeno např. dialogem) K vytvoření těchto vazeb opět slouží položka "ŘEŠÍME JAKO". Toto "slití" několika položek národního číselníku na jednu položku číselníku interního je nekorektní a v blízké budoucnosti by mělo být odstraněno. Nicméně v roce 1997 takto pracuje ještě většina informačních systémů (zejména IS pro praktické lékaře) a proto je nutné tento stav na straně příjemců po jistou dobu respektovat. Rozhodně by toto nemělo být tolerováno na straně laboratoří, které by měly rozlišovat "procedury" co nejdříve. Poznámka: tam, kde bude docházet k výše uvedenému "slévání" výsledků na jednu implicitní položku, bude nutné ukládat společně s výsledkem i jeho interpretační škály nebo alespoň referenční rozmezí. 1d.) Pokud by takovýto výše uvedený jednoduchý IS exportoval tato data za pomoci datového rozhraní do jiného IS, řešil by to takto: VÝSTUP Z IS IS národní číselník položek interní číselník položek SYST_KOMP_* <---------- SYSTi_KOMPi_* SYST_KOMP_PROC1 (bez vazby) SYST_KOMP_PROC2 (bez vazby) SYST_KOMP_PROC3 (bez vazby) Pokud není procedura zjistitelná, lze používat pouze tuto implicitní proceduru ("*"). Pozor vždy musí být respektována jednotka konvenční! 2.) Tam, kde například LIS nerozlišuje "systémy" tak, jako jsou rozlišovány v národním číselníku a kde se pracuje spíš s pojmy "materiál", mohou být vytvářeny vazby, které si znázorníme na příkladu: NIS LIS národní číselník interní číselník položek P_ALPBONE_ELP> P_ALPBONE_ELP (catc.) ALP(P)_ALPBONE_ELP ---> P_ALPBONEFR_ELP (catfr.) Katalytická frakce (catfr.) je stanovována v systému ALP; materiál, který se laboratoři zasílá, je plasma. (Nutno dát pozor na druhy veličin a jednotky.) Podrobnosti jsou uvedeny v číselníku laboratorních položek. 3.) Pokud laboratoř zašle výsledky pomocí datového standardu do IS, který plně používá národní číselník položek, budou zobrazovány výsledky takto: LIS NIS národní číselník položek interní číselník položek totožný s národním číselníkem SYST_KOMP_* ----------> SYST_KOMP_* SYST_KOMP_PROC1 ----------> SYST_KOMP_PROC1 SYST_KOMP_PROC2 ----------> SYST_KOMP_PROC2 SYST_KOMP_PROC2 ----------> SYST_KOMP_PROC3 Je věcí konkrétního systému a jeho uživatelů, zda zde bude k dispozici nástroj (například pro některá oddělení a to na jejich výslovný požadavek) pro "slévání" výsledků na položku bez specifikované procedury - například: NIS část NIS národní číselník položek interní číselník položek SYST_KOMP_* ----------> SYST_KOMP_* SYST_KOMP_PROC1 ----------> SYST_KOMP_* SYST_KOMP_PROC2 ----------> SYST_KOMP_* SYST_KOMP_PROC2 ----------> SYST_KOMP_PROC3 Toto řešení je umožněno, ač není v systému "SLP" považováno za vhodné a korektní. Je ovšem zřejmé, že některá oddělení nebudou ochotna přijmou tento exaktní přístup a bude pro ně potřeba realizovat některá zjednodušení. V každém případě je nutné, aby tato záležitost byla důkladně prodiskutována, aby byly objasněny případné klinické důsledky plynoucí z těchto úprav a aby byla tato úprava vyžádána písemně. POČÁTEČNÍ NAPLNĚNÍ KONVERZNÍHO SOUBORU: --------------------------------------- Soubory LP_KONV mohou být dodávány připravené. Vždy, když jsou do souboru LABPOLZ doplněny další položky národního číselníku, jsou také automaticky doplněny do souborů LP_KONV v distribuční verzi. S těmito soubory je nejvýhodnější pracovat za pomoci informačního systému SLP, který zajišťuje, aby nově vložený záznamu měl již vhodně naplněné položky NÁRODNÍ KLÍČ a NÁRODNÍ KÓD (jsou neměnné, zajišťují vazbu mezi LP_KONV a LABPOLZ). Do souboru LP_KONV se také fakulativně nakopírují následující položky: - interní gesce (=gesce z popisu položky) - interní název (=název pro nálezy z popisu položky) - název pro laboratorní příručku (=systém a název pro nálezy) - jednotka (=jednotka konvenční z popisu položky) - přepočet (= "1") - stav a odběr Tyto všechny dialogové položky jsou editovatelné, uživatel je může libovolně vhodně měnit. Položky "jednotka" a "přepočet" může využívat spolupracující informační systém pro vytváření přepočtů mezi jednotkami. Protože do dialogu "POLOŽKY" nemohou běžní uživatelé vstupovat, jsou do souboru LP_KONV zařazeny také ty dialogové položky, které logicky patří k popisu položky laboratorní, ale které mohou být modifikovány také uživatelem. Jedná se o: - stav materiálu, - odběr vzorku, - specifikace systému, - pořadí (fakultativní položka). Výjimečné místo zaujímá položka "škála". V dialogu "POLOŽKY" je vyplněna dialogová položka "kód škály", která odkazuje na příslušnou (vypracovanou) interpretační škálu. Pokud by uživatel potřeboval provést přesměrování na škálu s jinou procedurou nebo systémem (týká se nejvíce implicitních procedur), vyplní položku "škála", kterou by měl IS uživatele uvažovat přednostně. ŠKÁLY K LABORATORNÍM POLOŽKÁM V Národním číselníku jsou vytvořeny vazby na připravovaný číselník interpretačních škál: S1 S2 S3 S4 S5 S6 S7 S8 --- -- - ref.meze + ++ +++ I------I------I------I------I------I------I------I- velmi velmi Body S1 a S8 vymezují pracovní rozsah grafu. Generování číselníků K vygenerování číselníků distribuovaných k všeobecnému použití, zejména pro potřebu informačních systémů (LIS, NIS) a pro vzájemnou komunikaci mezi nimi na základě standardního datového rozhraní, slouží informační systém SLP, pomocí kterého jsou číselníky vytvářeny i udržovány. Uživatelská verze systému SLP je k dispozici. POPISY GENEROVANÝCH SOUBORŮ: ============================ LABPOLZ.TXT ----------- Obsahuje seznam všech položek definovaných v číselníku "laboratorních položek", je setříděný podle klíče "KLIC". Vychází z databazového souboru LABPOL systému "SLP". Z číselníku LABPOLZ jsou odkazy na číselníky další - viz popis. Prostřednictvím MZd je distribuován pouze číselník, obsahující pouze položky národního číselníku (typ=N), pomocí systému "SLP" je možné vygenerovat také položky z regionálního ("R") nebo lokálního ("L") číselníku. Informace obsažené v jednotlivých sloupcích číselníku: (jsou připojeny pouze orientační popisy) označení délka stručný popis ("/"= odkazy na jiné generované číselníky), JMÉNO položky v databazovém souboru LABPOL -------- --- ------------------------------------------ 01 klic 5 klíč (národního číselníku) KLIC 02 kodtext 26 kód (národního číselníku) KODTEXT 03 typ 1 typ číselníku TYP (N=národní,R=region.,L=lokální) 04 gesce 1 gesce odborníka v oboru GESCE (B, I, H, M, Z, .....) 05 vznik 1 typ položky dle vzniku nebo použití VZNIK /LP_VZNIK/ 06 kodsyst 8 kód systému KODSYST /LP_SYST/ 07 kodkomp 8 kód komponenty KODKOMP /LP_KOMP/ 08 kodproc 8 kód procedury KODPROC /LP_PROC/ 09 nazevnal 24 název komponenty pro nález NAZEVNAL 10 kvant 8 druh kvantity KVANT /LP_DKVAN/ 11 jednkonv 12 jednotka konvenční (rozměr) JEDNKONV 12 typdial 3 typ položky dle dialogu a hodnoty TYPDIAL /LP_TYPD/ 13 vztah 1 vztah k nadřazené položce 14 formrm 1 formát referenčních mezí FORMRM /LP_FRM/ 15 formh 2 formát hodnoty FORMH /LP_FH/ 16 trendlim 3 trend - časový limit pro hodnocení 17 trendmer 6 měřítko pro hodnocení trendů 18 md 8 mez dolní (přípustná nejnižší číselná hodnota) MD 19 min 8 běžná minimální hodnota - měkká mez 20 max 8 běžná maximální hodnota - měkká mez 21 mh 8 mez horní (přípustná nejvyšší číselná hodnota) MH 22 mtv1 8 množina textových výsledků 1 MTV /LP_MTV/ 23 mtv2 8 množina textových výsledků 2 MTV /LP_MTV/ 24 mtv3 8 množina textových výsledků 3 MTV /LP_MTV/ 25 mtv4 8 množina textových výsledků 4 MTV /LP_MTV/ 26 dat_zmen 8 datum změny (u nově definovaných je prázdné) DAT_ZMENY 27 neakt 1 logická proměnná (true=neaktuální) AKTUALNOST 28 plati_od 8 platnost položky od data PLATI_OD 29 plati_do 8 platnost položky do data PLATI_DO (není-li datum uvedeno, není platnost omezena) 30 kodskal 26 odkaz do souboru LP_SKALY, kde je pod tímto kódem uložen popis škály /LP_SKALY/ KODSKAL (viz též odkaz v KONVPOL a LP_KONV) 31 vybskal 8 odkaz na algoritmus, pro speciální VYBSKAL výpočet škály (vyjímečně) 32 kodpoj 5 kód položky dle číselníku zdrav. pojišťoven (jen pro informaci!) KODPOJ 33 lxo 26 odkaz na položku, ve které je uložena informace o odpovídajícím objemu materiálu LXO 34 lxt 26 odkaz na položku, ve které je uložena informace o odpovídajícím času sběru LXT 35 lxx 26 odkaz na položku, ve které je uložena informace o laboratorní položce, ke které je popisovaná položka ve vztahu ("obálka") LXX LP_KONV.TXT (v systému SLP odpovídá KONVPOL.DBF) ----------- označení délka stručný popis -------- --- ------------------------------------------ 01 klicnar 5 klíč položky v národním číselníku (dodává se) 02 kodnar 26 kód položky v národním číselníku (dodává se) 03 int_gesce 1 gesce nad položkou v interním číselníku 04 res_jako 26 řeší se jako položka - kód položky z interního číselníku pro vytvoření vazby směrem od národního číselníku k internímu 05 kodint 26 kód (klíč) položky v interním číselníku IS pro vytvoření vazby z interního číselníku na číselník národní (jednoznačná vazba) 06 jednint 12 jednotka (rozměr) položky v interním číselníku 07 prepfak 16 přepočítávací faktor (číslo real) 08 konverze 16 konverzní funkce (kde nelze využít prepfak) 09 nazevint 24 název komponenty v interním číselníku pro zobrazování v lokálních nálezech 10 nazevlp 68 plný název pro zobrazování v laboratorní příručce (může obsahovat i systém-materiál) 11 poradi 8 pořadí pro zobrazování v běžném denním nálezu - dle správce lokálního číselníku 12 lxs 26 stav materiálu (ve vazbě na systém SLP) 13 lxz 26 typ odběru (ve vazbě na systém SLP) 14 lxd 26 specifikace systému 15 kodskal 26 odkaz do souboru LP_SKALY, kde je pod tímto kódem uložen popis škály /LP_SKALY/ KODSKAL (viz též odkaz v LABPOL a LABPOLZ, je-li vyplněno zde, má přednost) 16 material 8 typ materiálu zasílaného k analýze 17 odber_do 8 typ odběrové nádobky (skla aj.) 18 mn_odb 4 minimální množství 19 jedn_odb 4 jednotky pro "mn_odb" 20 mn_anal 4 množství potřebné pro samostat. analýzu 21 jedn_anal 4 jednotky pro "mn_anal" 22 dostupnost 26 dostupnost vyšetření 23 odezva 8 časová odezva laboratoře 24 rutina 26 kde je zpracováváno rutinní vyšetření 25 statim 26 zda a kde je zpracováváno statimové vyš. 26 dat_akt 8 datum aktualizace (poslední, dle systému SLP) 27 J_akt 2 kód aktualizujícího uživatele (dle systému SLP) Pomocný soubor, který využívá systém SLP a který bude využíván pro konverzi položek při jejich předávání mezi informačními systémy za pomoci standardních datových rozhraní. Tento soubor MZd nevydává. Běžně se dodává jako prázdný, s vyplněnými položkami "KLICNAR" a "KODNAR" a případně i s názvy. Ostatní položky se váží ke konkrétnímu internímu laboratornímu systému uživatele. Jeho naplnění může zajistit firma, která dodává IS. LP_SYST.TXT ----------- 01 kod 8 kód systému 02 nazev 55 název systému plným textem LP_KOMP.TXT ----------- 01 kod 8 kód komponenty 02 nazev 140 název komponent plným textem (pro laboratoře) LP_PROC.TXT ----------- 01 kod 8 kód procedury 02 nazev 55 název procedury plným textem (pro laboratoře) LP_DKVAN.TXT ------------ 01 kod 8 kód druhu kvantity 02 nazev 55 název druhu kvantity plným textem LP_TYPD.TXT ----------- 01 kod 8 kód typu položky z hlediska dialogu a hodnoty 02 nazev 55 název a charakteristika typu dial. položky LP_FRM.TXT ---------- 01 kod 1 kód formátu pro ref. meze numerické položky 02 nazev 55 název a charakteristika formátu referenčních mezí LP_FH.TXT --------- 01 kod 2 kód formátu hodnoty pro vydávání numerických výsl. 02 nazev 55 název a charakteristika formátu hodnoty LP_MTV.TXT ---------- 01 kod 8 kód matice formalizovaných textových výsledků 02 nazev 55 název matice formalizovaných textových výsledků 03 mtvkod 8 kód formalizovaného textového výsledku 04 mtvnazev 55 název formalizovaného textového výsledku, text (vázaný ke kódu matice) Poznámka: Popisy pro soubory *.TXT i *.DBF jsou totožné, liší se pouze formou ne obsahem. PŘÍLOHY: 1. Interní číselníky 2. Vybrané položky Národního číselníku laboratorních položek 3. Datové soubory LABPOLZ a pomocné soubory LP_* ve tvaru DBF a TXT Zpracovali: Ing. Miroslav Zámečník MUDr. Antonín Jabor, CSc 19. listopadu 1996 Obsah 2 Odborné společnosti spolupracující na systému 2 Adresy odborných společností 3 Autorský kolektiv 6 Úvod 9 Základní definice 13 Schéma vazeb mezi pojmy 14 Definiční charakteristiky 15 Systém 17 Komponenta 20 Procedura 21 Druh veličiny 25 Jednotka 27 Použité materiály 28 LABORATORNÍ POLOŽKY: 28 Klíč 28 Typ 29 Systém 29 Komponenta 29 Procedura 29 Kód 30 Gesce 30 Vznik 34 Název (pro nálezy) 34 Plný název komponenty 35 Druh kvantity 35 Jednotka konvenční 35 Typ položky z hlediska dialogu 35 Formát referenčních mezí 35 Formát hodnoty 36 MD 36 D 36 H 36 MH 37 MTV 37 Matice textových výsledků 38 Kód škály pro interpretaci 38 Stav materiálu 38 Odběr 39 KONVERZE ČÍSELNÍKŮ 43 ŠKÁLY K LABORATORNÍM POLOŽKÁM 44 GENEROVÁNÍ ČÍSELNÍKŮ, POPIS GENEROVANÝCH SOUBORŮ 44 labpolz (k dispozici na www) 45 lp_konv (jen struktura) 46 lp_syst (k dispozici na www) 46 lp_komp (k dispozici na www) 46 lp_proc (k dispozici na www) 46 lp_dkvan (k dispozici na www) 46 lp_typd (k dispozici na www) 46 lp_frm (k dispozici na www) 46 lp_fh (k dispozici na www) 46 lp_mtv (k dispozici na www)
Základní informace o společnosti | Výbor společnosti | Členská přihláška | Akce pořádané společností